在冷藏集裝箱租賃冷藏裝置的操作期間，蒸發器盤管上會形成冰層，這取決于設定溫度，貨物溫度，通風裝置新鮮空氣的數量以及貨物的濕度等。制冷裝置會定期進入除霜狀態，由一系列的電加熱裝置產生熱量或者向蒸發器盤管吹入熱氣。所有的風扇在此時會停止轉動以防熱氣進入貨艙。然而， 由于回風溫度感應器位置接近制冷裝置，此種溫度升高可能會被記錄下來。因此，除非經數據記錄軟件處理，否則溫度記錄將會呈現與除霜間隔時間一致的周期性溫度升高。如果除霜期間短暫，每小時的溫度讀數和除霜期間可能會有一定出入。 應注意此種溫度讀數的增加并不會立即對貨物的實際溫度產生影響，也并不意味著制冷裝置處于不穩定狀態。電子數據記錄除了溫度以外，通常還會顯示除霜間隔和持續時間。如果裝貨溫度超過了設定溫度，冷藏裝置將會開始自動的將貨物溫度降至符合要求的溫度水平。如果貨物已經解凍，冷藏集裝箱冷藏裝置將會嘗試降低貨物溫度但會持續頻繁進行除霜。
除了貨物的設定值和送風、回風溫度外，溫度控制系統還會以錯誤代碼的形式提供有關系統問題的詳細信息。貨物溫度可通過美國農業部（USDA）探測儀記錄，安裝該探測儀是為了符合美國農業部針對水果的運輸的冷藏處理程序。托運人放置于所載貨物中的數據記錄儀也會記錄大體溫度。當冷藏裝置失靈時，溫度顯示和數據記錄將會展示一個逐漸穩定的溫度上升直至*終達到周圍環境溫度值過程。再次強調，感應器只會記錄空氣溫度，而非貨物溫度。貨物將會受到周圍絕熱材料一定的保護，防止受到外部空氣溫度的影響。
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